Zebranie organizacyjne Krakowskiego Oddziału Stowarzyszenia "Wspólnota Polska" odbyło się 27 czerwca 1990 roku. Wytyczono na nim kierunki pracy Oddziału oraz wybrano pierwszego prezesa. Został nim prof. Aleksander Koj - rektor Uniwersytetu Jagiellońskiego.
Oddział Krakowski liczy 297 członków oraz ma jedno koło terenowe w Zakopanem, w którym działa 20 osób.

Początkowo w działalności Oddziału Krakowskiego, przeważała pomoc typu humanitarnego, organizowana z myślą o Polakach mieszkających za wschodnią granicą. Dużą rolę odgrywały również zagadnienia związane z repatriacją Polaków z Kazachstanu.

W ciągu kilkunastu lat działalności nastąpiło wyraźne ukierunkowanie programu realizowanego przez Oddział Krakowski. Priorytet stanowią w nim zadania o charakterze edukacyjno-oświatowym. W ofercie oddziału znajdują się różnorodne kursy adresowane do osób polskiego pochodzenia, które pragną pogłębić swoją znajomość języka, historii i kultury polskiej.

Kolejnym kierunkiem działalności jest promocja artystów polskiego pochodzenia wśród mieszkańców i turystów Krakowa. W zabytkowych salach Domu Polonii odbywają się występy polskich i polonijnych zespołów folklorystycznych i chórów, przedstawienia małych form teatralnych oraz koncerty fortepianowe.
Galeria Domu Polonii prezentuje rocznie około dziesięciu wystaw prac artystów polskiego pochodzenia reprezentujących różne kierunki i style we współczesnym malarstwie, a także wystawy fotograficzne dokumentujące losy Polaków poza granicami kraju.

Ważnym kierunkiem działalności Oddziału Krakowskiego pozostaje organizacja pomocy charytatywnej dla polskich środowisk na Wschodzie. Polega ona na przyznawaniu zapomóg finansowych osobom znajdującym się w trudnej sytuacji życiowej oraz udzielaniu pomocy w zakresie leczenia i zakupu lekarstw.

Od początku swojej działalności Oddział Krakowski organizował lub był współorganizatorem dużych zjazdów, konferencji i spotkań polonijnych. Ich celem była wymianie doświadczeń oraz wspólne ustalenia dotyczące potrzeb Polonii i Polaków mieszkających za granicą.

W Krakowie odbyły się:

• VII Polonijne Igrzyska Sportowe (1991 r.)
• Zjazd Polonii i Polaków (1992 r.)
• Zjazd Przedstawicieli Domów Polskich i Domów Polonii ze Świata (1996 r.)
• II Zjazd Polonii i Polaków z Zagranicy (2001 r.)
• IV Forum Oświaty Polonijnej (2002 r.)
• Konferencja "Polonia a Unia Europejska" (2003 r.)
• Kongres Polskich Towarzystw Naukowych na Obczyźnie (2005 r.)
• V Forum Oświaty Polonijnej (2006 r.)
• II Kongres Polskich Towarzystw Naukowych na Obczyźnie (2008 r.)